Né en 1952 à Garoua, dans la région du Nord, Marafa Hamidou Yaya fait ses études primaires et secondaires dans la même ville jusqu’à l’obtention du Baccalauréat D en 1973 au Lycée de Garoua.
Ses études supérieures commencent à la Faculté des Sciences de l’Université de Yaoundé (1973-1976), où il obtient la Licence en Géologie en 1976. Puis c’est le départ pour les Etats-Unis à la suite d’un concours lancé par l’African American Institute (A.A.I). Il étudie à l’Université du Kansas, où il obtient le Master of Science degree en Petroleum Engineering (Génie Pétrolier) en 1980.
De retour au bercail, il travaille d’abord comme Ingénieur de pétrole à El-Serepca à Douala de mai à Septembre 1980, avant d’intégrer la SNH. De Juin 1981 à Septembre 1990, il est Chef du département Exploitation-Production. De Septembre 1990 à Novembre 1992, il est Conseiller Technique dans la société, où il s’est occupé des relations avec le Fonds Monétaire International et la Banque Mondiale. Puis il sera tour à tour : Secrétaire d’Etat n°2 au Ministère des Finances (27 Novembre 1992- Juillet 1994), Conseiller Spécial du Président de la république (Juillet 1994-08 Décembre 1997), SG de la Présidence de la République (08 Décembre 1997-27 Avril 2001) et Ministre d’Etat Secrétaire Général à la Présidence de la République (27 Avril 2001- 24 Août 2002). Du 24 Août 2002, jusqu’en 2011, il est Ministre d’Etat chargé de l’administration Territoriale et de la Décentralisation. Depuis 2012 l’ancien homme fort du gouvernement Biya, est en prison pour une affaire de détournement de fonds public, dans le cadre de l’opération épervier.